一、根结线虫分类手段的研究概况（论文文献综述）
党金欢[1]（2021）在《昆玉市设施番茄和无花果根结线虫的鉴定及防治研究》文中进行了进一步梳理近年来,根结线虫病在昆玉市辖区设施病害中呈现高发趋势,对设施作物的生产造成了很大的损失,因此本研究开展了对昆玉市辖区番茄和无花果根结线虫病的发生情况调查研究,并运用形态学特征和分子生物学相结合的方法鉴定根结线虫的种类,对根结线虫病害的安全防控技术进行初步探索,主要研究结果如下:1.研究发现,根结线虫病在昆玉市224团和皮山农场均有分布,平均发病率达到58.8%;224团寄主为番茄的根结线虫病平均发病率为100%,且土壤中线虫密度为2000条/200g土样,寄主为无花果的根结线虫病平均发病率相对较低,为41.67%,土壤中线虫密度为1260条/200g土样。2.采用形态学特征和根结线虫基因不同区域通用引物及特异性引物PCR扩增相结合的方法进行鉴定,并构建了系统进化树,结果表明昆玉市224团番茄根结线虫主要为南方根结线虫（Meloidogyne incognita）;昆玉市224团无花果根结线虫有南方根结线虫（Meloidogyne incognita）、花生根结线虫（Meloidogyne arenaria）和摩洛哥根结线虫（Meloidogyne morocciensis）,昆玉市皮山农场和和田玉龙喀什镇无花果根结线虫为南方根结线虫（Meloidogyne incognita）和花生根结线虫（Meloidogyne arenaria）的混合种群。以上结果表明南方根结线虫（Meloidogyne incognita）为当地优势种。3.采用含有根结线虫病土接种法接种番茄苗在室内进行盆栽试验,对比淡紫拟青霉、哈茨木霉和氟烯线砜3种药剂对根结线虫的防治效果,结果表明3种药剂在生产上对防治根结线虫都具有较好的防治效果,在45d后的防效都可达到95%以上;但试验中发现氟烯线砜容易对植物造成严重的危害,不易操控。4.高温闷棚处理结果显示鸡粪+灌水+覆膜处理对根结线虫病有较好的防治效果,其防治效果达到80%,但随着种植时间的推移,在150d后其防治效果明显减弱,仅为48.48%;在闷棚处理的基础上,种植番茄60d后,如果再施用淡紫拟青霉与哈茨木霉2种生物菌剂进行处理可以达到较好的防效,防治效果均可达85%以上;从生物药剂施用浓度和防治效果可知,淡紫拟青霉的防治效果略优于哈茨木霉的防治效果。5.生物菌剂与化学药剂对比试验结果表明,2%阿维菌素+13%噻唑膦的防效最好,为94.7%;其次,是施用浓度为3.0g/m2的淡紫拟青霉和施用浓度为6.0g/m2的哈茨木霉,防治效果为89.5%,生物菌剂的防效略高于氟烯线砜,且在本试验设置的施用浓度范围内对根结线虫的防效随着生物菌剂施用浓度的增加而增加;从单位用量分析,表明淡紫拟青霉对根结线虫的防治效果也优于哈茨木霉,建议在选择生物菌剂防治根结线虫时首选淡紫拟青霉,其次是哈茨木霉。
王建宇[2]（2021）在《根结线虫生防菌高地芽孢杆菌AMCC1040的筛选及杀线虫作用机理研究》文中提出根结线虫病是由根结线虫引起的严重危害植物根系的土传病害,该病在全球范围内对作物造成巨大的经济损失,是严重制约农业发展的重要因素之一。根结线虫的防治目前仍以化学防治为主,但是高毒化学杀线剂给人类健康及生态环境造成的负面影响日益突出,一些环境友好型的替代手段如生物防治逐渐受到人们的重视。在根结线虫的生防因子中,根际细菌由于其功能明确,产业化前景好已受到广泛关注。本研究以南方根结线虫为靶标,开展了山东省蔬菜主产区抑病性土壤样品中可培养杀线虫细菌的分离筛选并对获得的高效杀虫菌种进行系统的分类鉴定;同时对菌株的杀线虫活性物质进行分析并结合生理生化、形态学及转录组学等方法研究了活性物质的作用机制;通过构建菌株的real time-PCR定量体系检测菌种的定殖能力并通过大田实验评价了菌剂的应用潜力及生态安全性,主要获得以下结果:（1）抑病性土壤中可培养细菌的分离及多样性分析。通过可培养的方法,根据菌落形态区分,从山东省蔬菜主产区13份抑病性土壤样品中共分离获得110株细菌。16S r RNA系统发育分析结果表明,110株细菌属于4个门,分别为Actinobacteria（放线菌门）,Bacteroidetes（拟杆菌门）,Firmicutes（厚壁菌门）以及Proteobacteria（变形菌门）,其中Firmicutes数量最多。在属水平上,110株可培养细菌分类于16个属,其中芽孢杆菌属占到总数的77.27%。（2）高效杀线虫菌种的筛选、鉴定。以南方根结线虫二龄幼虫为靶标,评价了110株细菌发酵上清液的杀线虫活性。结果表明,41.44%的可培养细菌对南方根结线虫二龄幼虫的致死效果达到50%以上,其中23株细菌的杀线虫率可达75%以上。一株芽孢杆菌AMCC1040对线虫的致死率可达100%,在盆栽实验中,该菌不仅能够降低土壤中的虫口密度及番茄病情指数,同时降低了卵囊形成数量,显着抑制了根结线虫病的发生与发展。根据Biolog生理生化实验、菌体形态特征及16S r RNA序列分析,Bacillus sp.AMCC1040经鉴定为高地芽孢杆菌（Bacillus altitudinis）。（3）Bacillus altitudinis AMCC1040田间防治效果评价。以大姜根结线虫病为研究对象,开展了Bacillus altitudinis AMCC1040菌剂全周期的大田防治实验。结果表明,菌剂能够显着降低土壤中的虫口密度,与空白对照相比,在收获期虫口密度下降了84.48%;同时该菌能够有效减少侵入大姜根系的线虫数,与空白及噻唑膦阳性对照相比,菌剂处理线虫侵染数分别降低了93.68%、58.59%;与空白对照相比,菌剂处理的雌虫数降低了82.91%,有效降低了再繁殖数;收获期菌剂处理的大姜根结线虫病病情指数与空白对照相比降低了57.14%。通过real time PCR检测,Bacillus altitudinis AMCC1040能够在大姜根际有效定殖,其定殖量为5.08～5.49 Log10CFU g-1土。在大姜收获期对各处理大姜根际微生态进行比较分析,评价菌剂的生态安全性。PCo A分析结果表明,三个处理的细菌群落结构存在显着差异;Alpha-diversity分析结果表明,阳性对照处理显着降低了大姜根际微生态群落的丰度及多样性,而菌剂处理与阳性对照相比有较好的生物安全性;Lef Se分析结果表明,不同处理中细菌结构组成差异显着,在菌剂处理中富集的三个门分别是Actinobacteria（放线菌门）,Gemmatimonadetes（芽单胞菌门）及Firmicutes（厚壁菌门）。（4）Bacillus altitudinis AMCC1040杀线虫活性物质的分析。活性物质基本性质研究结果表明Bacillus altitudinis AMCC1040产生的活性物质具有良好的热稳定性及遗传稳定性,同时耐受酸性环境,对碱处理敏感。冷冻干燥实验结果表明,经冷冻干燥后的残留固形物用蒸馏水复溶后无杀虫活性;旋蒸实验结果表明,旋蒸瓶内的残余黄色胶状物质无杀虫活性,冷凝瓶中的冷凝液体对J2s的致死效果可达100%。综合上述结果本研究发现由Bacillus altitudinis AMCC1040产生的杀线虫活性成分为挥发性物质。通过HS-SPME-GC/MS分析,在Bacillus altitudinis AMCC1040发酵上清液中共检测出8种特征性挥发性成分,其中6种具有较强的杀线虫活性,分别为2,3-butanedione（2,3-丁二酮）,acetic acid（乙酸）,2-isopropoxy ethylamine（2-氨乙基异丙醚）,3-methyl-butanoic acid（3-甲基丁酸）,2-methyl-butanoic acid（2-甲基丁酸）及octanoic acid（正辛酸）,其中正辛酸杀线虫活性最强,其LC100/12h为0.03μL/m L。（5）正辛酸杀线虫作用机理。结合转录组法、生理生化测定及形态学观察分析了正辛酸的作用机制。结果表明,正辛酸杀虫具有明显的浓度-时间特征,0.03μL/m L为低杀线虫浓度,此浓度下完全致死线虫需要12h;而在0.08μL/m L浓度下,正辛酸表现出极强杀线虫活性,处理15min后即能达到100%杀虫率。正辛酸能够显着破坏线虫的虫体结构,造成内含物流失,随着处理时间的增长,高浓度辛酸处理的虫体体壁变得不完整,肠、咽等结构被完全破坏并出现质壁分离现象,同时线虫的糖类和蛋白质等结构成分含量也显着降低。通过对上述两种浓度处理下线虫差异基因的GO和KEGG富集分析,并结合生理生化及RT-PCR验证试验证明了正辛酸能够干扰线虫能量代谢及信号传输,破坏线虫的角质层等体壁结构,同时还能抑制线虫的神经及运动系统最终导致线虫的麻痹死亡。此外,线虫在应对低浓度正辛酸的侵害时会启动自身的防御系统,通过上调防御酶体系及异源代谢途径抵抗辛酸的危害。
李天予[3]（2020）在《邯郸市设施蔬菜根结线虫发生现状、种类鉴定及毒性变异研究》文中提出根结线虫（Meloidogyne spp.）是一类重要的病原物,其种类多、寄主范围广、个体微小、分布广泛。近年来,我国设施蔬菜种植面积迅速扩大,复种指数增加,导致根结线虫病害日益严重,严重影响农作物的产量与品质。然而,邯郸市设施蔬菜根结线虫的发生情况、种类、毒性变异情况尚不清楚。因此,及时调查清楚该地区根结线虫发生情况,准确、可靠地鉴定出该地区根结线虫的发生种类和毒性变异情况,对该病害的防治至关重要。1.邯郸市设施蔬菜根结线虫发生分布和为害情况调查本研究选取设施蔬菜种植面积较大的曲周县、馆陶县、鸡泽县、永年区、肥乡区和丛台区等6个县（区）的22个乡镇作为调查点,共采集235个样品。结果显示,曲周县第四疃镇根结线虫发病率最低,为33.3%,肥乡区辛安镇镇和毛演堡乡发病率最高,为60%;第四疃镇病情指数最低,为13.9,毛演堡乡病情指数最高,为41.7,肥乡区发病率和病情指数均高于其他地区。初步明确邯郸市设施蔬菜根结线虫的发生分布和为害情况。2.邯郸市设施蔬菜根结线虫种类的鉴定及优势种群的确定选取具代表性的22个样点进行种类鉴定和优势种群的确定。对二龄幼虫的形态测计和雌虫的会阴花纹进行形态学鉴定。结果显示,二龄幼虫的体长为389（360～430）μm,口针长11.5（11.0～12.3）μm,尾长51.7（50～53）μm;雌虫会阴花纹背弓高,似方形,侧线清晰,线纹粗到细,清楚。这些结果与已报道南方根结线虫形态特征相似度最高。采用分子生物学技术手段对形态特征进一步印证。采用通用引物扩增样品的r DNA-ITS序列获得片段大小约为480 bp,回收纯化PCR产物进行测序,blast比对结果显示,与已提交的南方根结线虫序列相似度高达98%,初步判定邯郸市设施蔬菜根结线虫发生种类为南方根结线虫。利用ITS序列构建系统发育树,结果显示与Gen Bank中已有的南方根结线虫、花生根结线虫和爪哇根结线虫聚类在一个大的分支上,亲缘关系较近。为准确鉴定根结线虫种类,利用5种根结线虫特异性引物分别对供试根结线虫样品进行PCR扩增,只有引物MIF/MI-R有目的条带,大小约为951 bp。结合形态学与分子生物学鉴定结果表明,调查样品全部为南方根结线虫。因此,邯郸市设施蔬菜根结线虫发生种类为南方根结线虫,而且为邯郸市根结线虫的优势种群。3.邯郸市设施蔬菜根结线虫群体的纯化及毒性测定随机从采集到的样品中分离纯化12个南方根结线虫群体,分别接种在感病番茄Sufen2003上培养,分离卵块并在无菌水中孵化制成二龄幼虫（J2）悬液,分别接种在抗病番茄（Lycopersicon esculentum cv.Nemax）上,每株2000条,45 d后逐级记录根结线虫发病程度。试验结果显示,12个群体都存在不同程度的毒性分化现象。抗病番茄对鸡泽县鸡泽镇北安上村南方根结线虫群体等8个群体表现为高抗,根结指数从0.6～1.0不等,对肥乡区辛安镇镇后贾庄等4个群体表现为抗性,根结指数从1.2～1.6不等。试验结果表明,抗性番茄对南方根结线虫不同群体的抗性程度并不一致,不同的南方根结线虫群体对抗性番茄的致病力也不是完全一致的。本研究初步明确了邯郸市根结线虫的种类、分布和毒性变异情况,为邯郸市根结线虫的综合防治和抗性品种布局提供了重要的理论依据。
李根[4]（2020）在《芽孢杆菌AMCC100018杀南方根结线虫活性物质的研究》文中指出根结线虫（RKNs）是一种植物病原生物,具有寄主范围广泛、传播途径简单、危害大以及防治困难等特点。根结线虫会侵染作物的根部,阻碍作物对水分、肥料等营养物质的吸收,前期会造成植株矮小、免疫力弱,后期则会造成作物的减产、绝产,甚至死亡,严重的危害了我国农业的发展。芽孢杆菌AMCC100018是由本实验室筛得的一株高效针对南方根结线虫的生防菌株。本研究首先验证了芽孢杆菌AMCC100018的杀虫活性稳定性,然后进行了分离纯化,利用质谱技术分析比对出了活性物质,验证了标品的杀虫活性。主要获得结果如下:芽孢杆菌AMCC100018的LB发酵液具有高效的杀虫活性,发酵48h即可达到最大值。菌株发酵液的杀虫活性具有良好的传代稳定性、耐高温、耐酸碱、无法被蛋白酶酶解,可以长时间见光贮藏。正丁醇、乙酸乙酯、三氯甲烷和环己烷这四种有机溶剂无法有效的萃取出杀虫活性物质,故杀虫活性物质属于水溶性成分。筛选了四种大孔吸附树脂、两种阳离子交换树脂以及两种阴离子交换树脂,这八种树脂无法有效的吸附杀虫活性物质。选用了XAD1180、XAD16N两种型号的大孔吸附树脂对发酵液进行了预处理,再使用RP-C18、葡聚糖凝胶（Sephndex LH-20）以及制备型液相等技术分离得到了色谱纯的白色物质,使用TLC显色反应以及红外光谱扫描推测其为多肽类或酰胺类。将分离后得到的活性物质使用LC-MS进行分析比对,推测化合物为5-氨基乙酰丙酸、甘油-L-脯氨酸、L-脯氨酰甘氨酸。鉴定了标品的杀虫活性,其中5-氨基乙酰丙酸具有杀南方根结线虫活性,其24h的LC100为0.8mg/mL。
宫远福[5]（2020）在《东北地区根结线虫的种类分布及南方根结线虫氯离子通道基因分析》文中进行了进一步梳理根结线虫（Root-knot nematode,RKN）是一类分布于世界各地的严重威胁农业生产的植物寄生线虫。我国根结线虫种类较多,多数分布在南方地区,对东北地区的根结线虫并未有一个相对全面的认识。因此,本研究对东北三省的根结线虫种类和分布进行系统调查,并对其抗药性产生机理进行初步分析,研究结果如下:2018年2019年,在辽宁省、吉林省和黑龙江省共采集174样本,其中56份样本发现根结线虫,采用形态学观察、rDNA-ITS和rDNA-SSU的序列分析和序列特异性扩增区标记鉴定出3种根结线虫,分别为南方根结线虫（Meloidogyne incognita）、北方根结线虫（M.hapla）和花生根结线虫（M.arenaria）。其中南方根结线虫在东北三省的温室大棚均有发现,是温室大棚里的优势种,辽宁省各个市区均有分布,吉林省仅在长春市和松原市、黑龙江省大庆市有少量分布,寄主主要集中于番茄、茄子和黄瓜。辽宁省抚顺市、辽阳市、丹东市、盘锦市和吉林省松原市温室大棚以前没有报道该病,本次调查发现有南方根结线虫危害,说明辽宁省各个市县设施蔬菜基地均有南方根结线虫入侵,并已扩散至吉林省。北方根结线虫在辽宁省丹东市和锦州市的温室大棚中,以及抚顺市、葫芦岛市和沈阳市露地蔬菜和植物上发现,是露地上的优势种,本次在辽宁省抚顺市露地上和丹东的温室大棚里发现北方根结线虫,以前没有报道;首次在东北的辽宁省沈阳市辽中县露地花生上发现花生根结线虫,说明花生根结线虫也已扩散至东北地区并越冬存活。利用南方根结线虫的ITS和SSU序列构建系统进化树分析,辽宁省的南方根结线虫大体分为两支:其中沈阳、铁岭、抚顺、本溪、鞍山、营口、丹东和大连的南方根结线虫归为一支,锦州、阜新、盘锦、朝阳和葫芦岛的南方根结线虫归为另一支。吉林省长春和松原种群与黑龙江省大庆发现的南方根结线虫种群与沈阳铁岭种群的亲缘关系较近,推测吉林省和黑龙江省的根结线虫很有可能从辽宁省由南向北部传播过去。在辽宁省大连市甘井子区中革村大棚采集到的南方根结线虫对阿维菌素产生了抗药性,通过触杀试验发现抗性种群比敏感种群的抗性高达到5.13倍。谷氨酸门控的氯离子通道（glutamate-gated chloride channel,GluCl）是阿维菌素作用于线虫体内的作用靶标,设计引物并克隆测序获得1259bp南方根结线虫的GluCl基因。将抗性和敏感种群GluCl进行核酸序列比对发现,抗性种群碱基发生18处同义突变,2处非同义突变,氨基酸序列比对发现在第22位点缺失天冬氨酸,在第110位点谷氨酰胺替换赖氨酸（Q110K）;通过对谷氨酸氯离子通道蛋白二级结构预测发现,抗性种群GluCl与敏感种群相比,其二级结构中α螺旋数量多、延展数量和无规则卷曲数量相对少,两者具有明显差异;GluCl蛋白三级结构预测发现,该抗性种群突变点在GluCl蛋白亚基五聚体外部Q110K位点上,可能与南方根结线虫的抗药性产生相关。本研究鉴定到东北地区根结线虫有3个种,主要分布在辽宁省各市县,而吉林省和黑龙江省温室中也有少量分布,首次在辽宁省沈阳市露地花生根系上发现花生根结线虫。发现对阿维菌素产生抗药性的南方根结线虫群体,解析到谷氨酸氯离子通道的基因序列、氨基酸和蛋白质结构变化。研究结果为指导东北地区根结线虫的防控,尤其是抗药性线虫群体的检测提供重要数据。
吴晓晶[6]（2020）在《北方根结线虫对温度和无机化合物适应性研究》文中认为北方根结线虫（Meloidogyne hapla）是冷凉作物区重要的病原线虫,危害严重。本文研究了北方根结线虫对温度、无机化合物和pH的适应性,初步探索了北方根结线虫在温度和无机化合物胁迫下的生理代谢响应特征,为生态防控北方根结线虫提供参考依据。结果如下:1.明确了北方根结线虫对温度的适应性:通过不同温度处理,发现北方根结线虫J2低温半致死温度（S50）为-2.22℃,高温S50为40.28℃;卵囊的致死低温为-18℃,41℃的卵囊孵化率为13.00%;且防冻脱水、冷激和冷驯化均可提高J2低温存活率。证实了北方根结线虫具有一定的耐寒性,但耐热能力较弱。2.明确了北方根结线虫对无机化合物和pH的适应性:通过8种无机化合物及不同pH 处理,发现北方根结线虫 J2 对 NH4HCO3、FeCl3·6H2O、CuC12·2H2O 和 CuSO4·5H2O敏感,LC50 分别 5.96 mM、0.77 mM、0.16 mM 和 0.16 mM,J2 存活的 pH 值范围为 4～12,说明该线虫对pH的适应性较强,且敏感化合物抑制北方根结线虫卵囊孵化。3.成功获得了温度处理和龄期处理下的北方根结线虫全长转录本:利用Iso-seq技术对北方根结线虫测序,得到70730条全长转录本,功能注释到61600条,并预测出1243个AS事件,26906个SSR和38787个完整CDS区以及3320个LncRNA。4.确定了北方根结线虫的内参基因:结合软件ACq、geNorm、Normfinder和BestKeeper以及RefFinder,评估11个候选内参基因在不同处理下的稳定性,并用Mh-Hsp90验证。最终确定RpS6和Mdh以及双内参RpS6+Mdh为适宜的内参基因。5.明确了北方根结线虫在温度胁迫下的生理代谢响应特征:通过检测北方根结线虫J2体内水解氨基酸的含量和脯氨酸合成途径关键酶的酶活及其基因表达情况,发现P5CS酶活随4℃胁迫时间的延长先升高后降低,MhP5CS和MhProC表达量增加,且脯氨酸含量增加,表明在温度胁迫下脯氨酸的积累主要依赖P5CS和ProC合成途径。通过检测钙信号途径,PI3K-AKT信号途径以及MAPK信号途径相关蛋白含量和相关基因表达情况,发现CaM含量以及MhCaM和MhCa2+ATPase表达量在低温胁迫下均升高,表明北方根结线虫J2通过CaM和Ca2+ATPase调节Ca2+浓度进而传导胁迫信号;此外,14-3-3 蛋白含量以及Mh14-3-3、MhAKT、MhHsp90（除-12℃处理外）和MhHsp70（除-12℃处理外）表达量均增加,说明PI3K-AKT信号途径的14-3-3蛋白和AKT直接抑制促凋亡蛋白（BAD）和FOXO,同时MAPK信号途径的AKT和Hsp70抑制JNK（c-Jun N-terminal kinase）进而抑制细胞凋亡途径。结果表明MAPK-AKT信号途径共同抑制BAD和FOXO,维持细胞正常存活。6.明确了北方根结线虫在无机化合物胁迫下的生理代谢响应特征:通过检测北方根结线虫J2体内水解氨基酸的含量和脯氨酸合成途径关键酶的酶活及其基因表达情况,发现FeCl3·6H2O和CuSO4·5H2O胁迫后OAT的酶活和MhOAT表达量均升高,表明脯氨酸的积累主要依赖OAT合成途径。而NH4HCO3胁迫后PDH酶活和MhPDH表达量均升高,脯氨酸减少,表明NH4HCO3促进脯氨酸降解。通过检测钙信号途径,PI3K-AKT信号途径以及MAPK信号途径相关蛋白含量和相关基因表达情况,发现CaM含量以及MhCaM和MhCa2+ATPase表达量均降低,表明胁迫抑制CaM和Ca2+ATPase调节Ca2+浓度。NH4HCO3胁迫后,PI3K-AKT信号途径的14-3-3蛋白含量以及Mh14-3-3、MhAKT和MhHsp90表达量增加,同时MAPK信号途径的MhAKT和MhHsp70表达量上调,表明MAPK-AKT信号途径共同抑制BAD和FOXO,维持细胞正常存活。CuSO4·5H2O和FeC13·6H2O处胁迫下,主要依赖14-3-3蛋白直接抑制 BAD。研究结果表明,北方根结线虫具有一定的耐寒性,耐热能力较弱,对无机盐CuCl2·2H2O、CuSO4·5H2O、FeCl3·6H2O和NH4HCO3较为敏感,线虫可通过调控脯氨酸合成代谢途径和钙信号途径以及MAPK-AKT信号途径,响应温度和无机化合物胁迫,进而维持机体正常的生理生化水平。
茶琦雁[7]（2020）在《产尿素细菌的物种多样性及其在线虫生防中的应用研究》文中指出根结线虫病是严重危害农作物的重要病害之一,多种化学杀线虫剂因高毒、高残留已相继被禁用,生物防治备受关注。产尿素细菌在脲酶催化下释放氨气杀线虫,是潜在的线虫生物防治新资源,然而目前对这类资源的发掘及应用少有报道。本文围绕产尿素细菌资源发掘及其在根结线虫病防控中的应用开展以下研究:（1）从蚯蚓粪便中分离筛选产尿素细菌,分析其物种多样性;（2）鉴定产尿素细菌新物种;（3）评估产尿素细菌在线虫生防中的潜力;（4）探究细菌产尿素分子机制;获得以下主要结果:1.采用可培养方法从蚯蚓粪样品中分离到246株细菌,根据脲酶催化尿素能够释放氨气原理,从中初筛选到53株产尿素细菌;进一步采用二乙酰一肟法测定细菌发酵液中的尿素含量,确定了38株细菌有产尿素功能;其中,7株细菌的LB培养基发酵液中尿素产量≥100?g/mL,6株细菌的NB培养基发酵液中尿素产量≥100?g/mL。系统发育分析显示,这38株产尿素细菌分属于四个类群:厚壁菌门（Firmicutes）、放线菌门（Actinobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）。其中,属于厚壁菌门的共16株,芽孢杆菌属（Bacillus）为优势属,共有10个种、14株。2.采用多相分类法,将从蚯蚓粪样品中分离得到的细菌1.1416T、1.3611T鉴定为新种,分别命名为Luteimonas lumbrici、Sphingobacterium lumbrici。3.采用平板测定法评估了38株产尿素细菌的杀线虫活性,30株对全齿复活线虫的致死率在17%-100%之间,其中,芽孢杆菌属（Bacillus）活性菌株最多,共10个种、14株,致死率在71%-100%,致死率≥90%有11株。有27株对根结线虫的致死率在5.34%-85.53%之间,其中6株的致死率达到≥70%。盆栽试验结果显示在试验的5株产尿素细菌中,B.zhangzhouensis 1.4517对番茄根结线虫病的防控效果最好,在自然土和灭菌土处理中的根瘤占比分别为27.91%（CK为46.5%）和5.13%（CK为11.97%）。4.探究了B.zhangzhouensis 1.4517的产尿素机制。该菌株存在精氨酸酶基因（RocF）且正常表达;该菌株的精氨酸由谷氨酸在多个合成酶、激酶的作用下生成,遵循经济途径,存在精氨酸酶代谢途径。通过转录组分析,发现1.4517菌株分别用NB、LB培养基培养时,与细菌产尿素相关的差异表达基因集中在精氨酸合成以及精氨酸酶代谢通路中。细菌的精氨酸通过精氨酸酶途径代谢生成尿素,提高菌株内精氨酸积累有助于够提高尿素产量。
杨帆[8]（2020）在《伴生植物根系分泌物对根结线虫及番茄抗性的影响》文中研究指明根结线虫（Meloidogyne spp.）病作为为害蔬菜生产的主要土传病害之一,对设施番茄（Solanum lycopersicum）生产造成的后果极其严重。由于人们对生态健康型农业的关注和对蔬菜产品质量的追求,生态安全的农艺型根结线虫防治技术已经成为研究热点。间套作（伴生）是防控土传病害最好的农艺措施之一,前期研究发现,分蘖洋葱伴生能减轻番茄根结线虫病害,但机理尚不清楚。因此,本研究采用盆栽试验,以分蘖洋葱（Allium cepa var.agrogatum Don.）、油菜（Brassica campestris L.）、薄荷（Mentha haplocalyx Briq.）和茴香（Foeniculum vulgare Mill.）等19种植物为试材,筛选出对根结线虫具有抑制作用的伴生植物;采用外源添加根系分泌物的方式明确伴生植物根系分泌物对根结线虫和番茄抗性的影响,旨在探明伴生减轻番茄根结线虫病害是否与根系分泌物直接抑制作用以及提高番茄抗性有关,为农艺型防控根结线虫病害技术的发展与应用,提供理论依据和技术支撑。主要研究结果如下:1.采用盆栽试验,从19种植物中筛选出了对番茄根结线虫有显着抑制作用的4种伴生植物,分别为分蘖洋葱、油菜、薄荷和茴香。2.采用外源添加伴生植物根系分泌物试验,结果表明,分蘖洋葱和油菜根系分泌物对根结线虫虫卵孵化的抑制作用最强;薄荷和茴香根系分泌物对根结线虫的趋向性显着降低;分蘖洋葱、油菜、薄荷和茴香4种植物根系分泌物均对根结线虫有较强的毒杀作用。3.通过分析添加伴生植物根系分泌物对番茄抗性影响的结果表明,分蘖洋葱、油菜、薄荷和茴香根系分泌物显着提高了接种根结线虫初期（1 d）后番茄根系防御酶SOD、PPO、PAL的活性,增加了总酚和木质素的含量,降低了番茄根系MDA含量。在接种根结线虫初期（1 d）,抗病相关蛋白PR1、多酚氧化酶（PPO）基因以及脂氧合酶（LOX）基因的相对表达量显着增加。4.通过对添加根系分泌物后接种线虫的番茄根系进行转录组分析表明,苯丙烷合成途径、内质网中的蛋白质加工途径、MAPK信号通路途径、植物激素信号转导途径以及植物-病原体相互作用途径等的相关基因得到显着富集。尤其在接种线虫1 d,抗病蛋白（酶）基因、木质素合成相关基因、植物激素代谢和转录因子相关基因等显着上调表达,表明番茄对根结线虫的抗性加强。综上所述,分蘖洋葱、油菜、薄荷和茴香伴生减轻番茄根结线虫病的根系分泌物机理为:一方面伴生植物根系分泌物通过抑制线虫卵的孵化、影响趋化性以及提高毒杀能力,直接抑制了根结线虫的侵染和繁殖;另一方面伴生植物根系分泌物通过提高番茄根系防御酶活性和上调抗病相关基因的表达,进而提高番茄对根结线虫的抗性。
黎烨[9]（2020）在《根结线虫侵染番茄过程中相关细菌菌群及其功能的宏基因组学分析》文中提出根结线虫是当下危害农作物较为严重,限制农作物连作的重要病虫害之一。随着高通量测序技术的广泛应用,发现植物病害的发生和控制与其紧密相关微生物的群落结构组成、功能组成存在一定联系。因此,探究根结线虫侵染与健康番茄根根内生微生物形成机制及其与根结线虫的相关性对开发新的生防微资源和生物防治策略具有重要的理论和实践意义。在先前工作的基础上,本文利用基因组高通量测序技术与蛋白组测序技术研究了健康与根结线虫侵染的番茄植株在发育过程中根内生细菌群落组成机制与菌群结构的差异,揭示内源微生物在健康与根结线虫侵染后不同时间段的组成机制、菌群的富集与功能差异。通过对先前获得的健康和根结线虫侵染的番茄根微生物组菌群结构及其功能的宏基因组学分析表明,随着番茄生长时间的推移,微生物多样性的差异越加明显,其中受根结线虫感染的番茄根结样品受时间的影响最大k=0.00145。并且所有处理组之间NTI和βNTI分布无明显差异,且βNTI值大部分处于-2到+2之间,表明在番茄生长过程中微生物的构建是以随机过程占主导地位,其中受根结线虫侵染后的根系微生物向确定性过程概率较健康番茄根系微生物的概率大。其中健康与根结线虫侵染的番茄根内生菌菌群结构、多样性与功能组成存在显着性（p<0.05）差异,线虫侵染后对番茄根内生菌的差异影响表现在细菌种类及丰度上。不同时期条件下健康与根结线虫侵染的番茄根内、根际土壤生菌菌群结构、多样性与功能组成也存在显着性（p<0.05）差异,不同生长时期对番茄根内生菌的差异影响表现在细菌种类及丰度上。与健康番茄根样品相比较,感染根结线虫的番茄根内伯克氏菌目（Burkholderiales）、根瘤菌目（Rhizobiales）以及放线菌目（Actinomycetales）出现高度富集,而健康番茄根内富集到放线菌目（Actinomycetales）、假单胞菌目（Pseudomonadales）、芽孢杆菌目（Bacillales）、黄杆菌目（Flavobacteriales）,黄单胞菌目（Xanthomonadales）、肠杆菌目（Enterobacteriales）等。结合宏基因组结果显示,与健康番茄根样品相比,根结中的放线菌目在芳香族化合物的代谢等功能丰度较高。在根结中显着性富集的伯克氏菌目以及根瘤菌目菌群具有富集了较为丰富的与芳香族化合物代谢以及氮代谢等功能相关的功能基因,潜在表明这些菌群可能参与了根结中氮代谢并可能参与了根结线虫氮源营养供应。进一步通过蛋白组解析了健康和线虫侵染不同时期下番茄根内生细菌的功能蛋白变化。结果表明,在不同生长阶段的健康番茄根内,差异蛋白主要参与微生物的生长和繁殖,其中包括核酸的合成与修复,ATP的合成以及细胞膜的构建,表明在健康番茄根系微生物在不同阶段下的生长繁殖较快,微生物简单交替变化明显,进而说明健康番茄根系微生物在不同时间下的多样性存在明显差异。在感染根结线虫的番茄根内,前期微生物参与的代谢过程仍然以核酸的合成与修复,ATP的合成以及微生物生长繁殖相关,在中后期阶段,差异蛋白出现对周围环境响应的次级代谢蛋白,表明在中后期微生物可能由于对周围环境的影响从而做出响应。感染番茄的根结中检测到根瘤菌所产生的结瘤蛋白以及固氮酶,因此相互印证根瘤的存在是与根结线虫的侵染相关联。通过比较线虫侵染根的根结与非根结部分的差异蛋白发现,应激生物学过程（response to stimulus）在根结初期开始富集。基于KEGG代谢通路分析发现,健康番茄生长不同阶段下,微生物在核酸修复、氨基酸代谢、光合作用以及碳固定差异较大。感染根结线虫番茄根样品中微生物在氨基酸代谢、氧化磷酸化细菌蛋白分泌等代谢存在显着性差异。在番茄根内生菌菌群结构解析的基础上,筛选对根结线虫侵染具有明显抑制活性的番茄根内生菌,大多数为芽孢杆菌类细菌。进一步通过16S扩增子测序解析不同生防细菌菌株在土壤的引入对感染根结线虫的番茄根内微生物群落结构变化的影响。结果表明不同菌株侵染番茄在一定程度上会造成门水平分类的差异,其中由芽孢杆菌CZ40、CZ51、CZ52、CZ53以及肠杆菌CZ45所侵染的样品中的厚壁菌门丰度相对较高,而由芽孢杆菌CZ6、CZ7以及CZ8则以变形菌门丰度居高。在目水平分类上,与对照组（Control）相比,不同菌株侵染后的番茄根内生细菌菌群结构变化更加明显,其中由芽孢杆菌侵染的CZ6、CZ7、CZ8以及CZ29中肠杆菌目显着高于其它处理组,而Fictibacillus barbaricus CZ40、Bacillus subtilis CZ51、Bacillus altitudinis CZ52以及Bacillus altitudinis CZ53所侵染的样品中的芽孢杆菌目显着（p<0.05）高于其它处理组,同样由芽孢杆菌CZ57、CZ65、CZ66、CZ67、CZ69、CZ71以及CZ75所侵染的样品中假单胞菌目丰度也显着（p<0.05）高于其它菌株侵染的结果。在α指数上样品CZ45、CZ51与MR2和对照组（Control）在OTUs指数和Chao1指数具有显着性差异（p<0.05）,实验组CZ53和对照组（Control）在Shannon指数和Simpson指数具有显着性差异（p<0.05）。LEfSe分析结果表明实验组与对照组番茄根内生细菌之间的差异主要集中在肠杆菌目、芽孢杆菌目以及绿弯菌门。其中,实验组中的芽孢杆菌目与肠杆菌目作为明显标志性生物。绿弯菌门和Kiloniellales在对照组中显着聚集,而Firmicutes（包括:Bacillus和Paenibacillus）以及Enterobacteriaceae的LDA score值均大于4,因此在实验组中影响根结线虫生长和繁殖的物种主要集中于厚壁菌门和肠杆菌目中。基于OTUs富集分析,差异热图以及曼哈顿图显示在对照组富集的菌群主要隶属于变性菌门中的根瘤菌以及绿弯菌门等自养型微生物。而实验组中富集的OTUs都是芽孢杆菌,表明芽孢杆菌在抑制根结线虫生长和繁殖可能发挥重要功能作用,这也与我们在先前筛选中得到的对根结线虫侵染具有明显抑制活性的细菌大多数为芽孢杆菌类细菌相一致。基于不同菌株的侵染实验,为进一步培养优化以及发酵工艺优化,提高细菌杀线虫活性物质及其具体的产量以及探索制备杀线虫菌剂的工艺和技术奠定理论基础。
傅昱[10]（2020）在《桑树对象耳豆根结线虫抗性反应的转录组分析》文中指出桑树是蚕桑产业的物质基础,桑树病害的发生对蚕桑的发展带来严重影响。桑树象耳豆根结线虫病是近几年被发现和报道的病害,有逐渐扩散的趋势,给蚕桑产业带来的经济损失不断增加,因此筛选抗象耳豆根结线虫桑树栽培品种及探究桑树抗象耳豆根结线虫机制对桑树抗病育种有重要意义。本研究鉴定了广东省12个桑树栽培品种对象耳豆根结线虫的抗性程度,并利用转录组测序技术分析了抗、感桑树品种受象耳豆根结线虫侵染后的防御调控机制,为桑树抗病基因的挖掘和抗病品种的选育提供了理论依据。主要研究结果如下:1.桑树品种的抗性鉴定。测定了12个桑树品种受到象耳豆根结线虫侵染后病情指数（DI）、根结指数（GI）、卵粒指数（EI）、繁殖系数（DR）的变化情况。结果显示,各品种接种30天后,DI为20.0077.30;GI为7.1523.70;EI为25.71736.95,DF为0.110.64,不同品种间各项抗性指标的变化情况存在差异。综合DI、GI、EI、RF进行聚类分析,可将桑树品种分为抗病、中感和高感三类,其中,粤桑C44、粤桑C8、粤桑51、粤桑C5、粤桑119为抗病,粤桑87、粤桑119、粤桑C10、283×抗10为中感,粤桑120为高感。以抗性指标中变异系数最大的EI进行聚类分析,结果与四项抗性指标聚类结果一致;再根据抗性指标的隶属函数值总和,确定了供试桑树品种对象耳豆根结线虫的抗性顺序。供试桑树品种抗性由强到弱依次为:粤桑11、粤桑C44、粤桑C8、粤桑51、粤桑C5、粤桑119、粤桑C33、粤桑87、粤桑C10、粤桑110、283×抗10、粤桑120。2.桑树对象耳豆根结线虫抗性反应的转录组分析。通过对42个象耳豆根结线虫侵染后不同时期的抗、感桑树样本进行转录组测序和Denovo组装,共获得55,894条Unigene,其中有33,987条Unigene被注释到Nr、Swissprot、KEGG和KOG数据库。通过对筛选到的抗、感桑树间差异表达基因（DEGs）和关键趋势中的基因进行富集分析,发现DEGs主要富集在细胞激素代谢过程、植物激素信号转导、黄酮类合成、苯丙烷类合成、过氧化物酶、光合作用等通路中。通过对关键趋势做共表达网络分析,发现桑树的抗病性可能与参与生物碱合成的柳叶水甘草碱16-O-甲基转移酶ROMT基因（Unigene0015083）、参与植物免疫过程中一氧化氮累积的zinc-finger转录因子（Unigene0073272）以及参与植物激素信号传导有关的ERF和MYB转录因子（Unigene0004006、Unigene0000628）的表达情况呈正相关。最后,挑选了21个差异基因进行RT-qPCR验证,证明了转录组结果的可靠性。
二、根结线虫分类手段的研究概况（论文开题报告）
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、根结线虫分类手段的研究概况（论文提纲范文）
（1）昆玉市设施番茄和无花果根结线虫的鉴定及防治研究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| abstract |
| 第1章 绪论 |
| 1.1 根结线虫的简介 |
| 1.1.1 病害症状 |
| 1.1.2 根结线虫病的危害及分布 |
| 1.1.3 根结线虫病防治困境 |
| 1.2 根结线虫的生物学特性 |
| 1.2.1 根结线虫的作用机理 |
| 1.2.2 根结线虫的发生规律 |
| 1.2.3 根结线虫发生的影响因素 |
| 1.3 根结线虫的分类与鉴定 |
| 1.4 新疆设施根结线虫的研究进展 |
| 1.5 根结线虫的防治技术 |
| 1.5.1 农业防治 |
| 1.5.2 物理防治 |
| 1.5.3 化学防治 |
| 1.5.4 生物防治 |
| 1.6 研究的内容 |
| 1.7 研究的目的和意义 |
| 第2章 根结线虫的种类鉴定 |
| 2.1 材料与方法 |
| 2.1.1 样本采集 |
| 2.1.2 试验方法 |
| 2.2 结果与分析 |
| 2.2.1 症状描述及根部分级标准的制定 |
| 2.2.2 根结线虫病发病情况调查 |
| 2.2.3 番茄根结线虫形态的鉴定 |
| 2.2.4 无花果根结线虫形态的鉴定 |
| 2.2.5 分子生物学鉴定及系统进化树的构建 |
| 2.3 小结 |
| 第3章 药效试验 |
| 3.1 材料与方法 |
| 3.1.1 试验地概况 |
| 3.1.2 试验材料 |
| 3.1.3 试验方法 |
| 3.2 结果分析 |
| 3.2.1 症状描述 |
| 3.2.2 盆栽试验效果 |
| 3.2.3 高温闷棚效果 |
| 3.2.4 高温闷棚结合生物药剂对根结线虫防治的效果 |
| 3.2.5 生物、化学药剂处理效果 |
| 3.3 小结 |
| 第4章 结论与讨论 |
| 4.1 结论 |
| 4.1.1 根结线虫病的发生与鉴定 |
| 4.1.2 药效试验结果 |
| 4.2 讨论 |
| 4.2.1 昆玉市根结线虫的发生 |
| 4.2.2 关于根结线虫的分类鉴定工作 |
| 4.2.3 药剂筛选试验 |
| 4.2.4 关于根结线虫病的防治研究 |
| 附录 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 作者简介 |
（2）根结线虫生防菌高地芽孢杆菌AMCC1040的筛选及杀线虫作用机理研究（论文提纲范文）
| 符号说明 |
| 中文摘要 |
| Abstract |
| 1 前言 |
| 1.1 根结线虫研究进展 |
| 1.1.1 根结线虫分类地位 |
| 1.1.2 根结线虫生活史 |
| 1.1.3 根结线虫危害 |
| 1.2 根结线虫的防治 |
| 1.2.1 化学防治 |
| 1.2.2 物理方法 |
| 1.2.2.1 土壤曝晒 |
| 1.2.2.2 热蒸汽 |
| 1.2.2.3 淹水 |
| 1.2.3 农业措施 |
| 1.2.3.1 植物残渣清理 |
| 1.2.3.2 轮作 |
| 1.2.3.3 种植抗性品种 |
| 1.2.3.4 土壤改良 |
| 1.2.4 生物防治 |
| 1.2.4.1 植物源杀虫化合物 |
| 1.2.4.2 食线虫真菌 |
| 1.2.4.3 放线菌 |
| 1.2.4.4 细菌 |
| 1.3 生防制剂的开发及应用 |
| 1.3.1 生防制剂开发现状 |
| 1.3.2 生防制剂在开发及应用中的问题及对策 |
| 1.3.2.1 菌种资源的进一步发掘 |
| 1.3.2.2 菌种安全性评价 |
| 1.3.2.3 生防制剂生产工艺及剂型研究 |
| 1.3.2.4 菌剂的应用技术研究 |
| 1.4 微生物源杀线虫化合物的发掘 |
| 1.4.1 天然产物的分析技术 |
| 1.4.1.1 萃取法 |
| 1.4.1.2 膜分离法 |
| 1.4.1.3 色谱法 |
| 1.4.2 微生物源杀线虫化合物 |
| 1.5 杀线虫化合物作用机制研究 |
| 1.6 本研究目的和意义 |
| 1.6.1 研究意义 |
| 1.6.2 研究内容及目标 |
| 2 材料与方法 |
| 2.1 实验材料 |
| 2.1.1 线虫材料 |
| 2.1.2 植物材料 |
| 2.1.3 培养基及常用储备液 |
| 2.1.4 主要试剂 |
| 2.1.5 色谱柱及填料 |
| 2.1.6 主要仪器 |
| 2.1.7 生化及基因提取试剂盒 |
| 2.2 实验方法 |
| 2.2.1 根结线虫二龄幼虫的大量获得 |
| 2.2.2 抑病性土壤样品的采集 |
| 2.2.3 根际细菌的分离、保藏 |
| 2.2.4 菌株杀线虫功能评价 |
| 2.2.4.1 菌株发酵上清液制备 |
| 2.2.4.2 杀虫试验 |
| 2.2.5 菌种鉴定 |
| 2.2.5.1 形态学及生理生化特征 |
| 2.2.5.2 分子生物学鉴定 |
| 2.2.6 盆栽试验 |
| 2.2.7 大田试验 |
| 2.2.7.1 试验地基本信息 |
| 2.2.7.2 试验设计 |
| 2.2.8 线虫相关指标测定方法 |
| 2.2.8.1 虫口密度测定方法 |
| 2.2.8.2 根系内线虫染色方法 |
| 2.2.9 高地芽孢杆菌real time-PCR定量检测体系 |
| 2.2.9.1 特异性引物设计 |
| 2.2.9.2 Real time-PCR扩增体系 |
| 2.2.9.3 重组质粒标准品的制备及标准曲线构建 |
| 2.2.10 根际微生态分析 |
| 2.2.11 高地芽孢杆菌AMCC1040 活性物质分析 |
| 2.2.11.1 活性物质基本性质 |
| 2.2.11.2 顶空固相微萃取-气质联用法分析挥发性成分 |
| 2.2.12 正辛酸杀线虫作用机理 |
| 2.2.12.1 二龄幼虫的富集 |
| 2.2.12.2 正辛酸母液配置 |
| 2.2.12.3 正辛酸杀线虫特性 |
| 2.2.12.4 正辛酸对线虫虫体结构的影响 |
| 2.2.12.5 正辛酸对线虫酶活影响 |
| 2.2.12.6 转录组测序 |
| 2.2.12.7 RT-PCR检测靶基因转录水平变化 |
| 2.2.13 数据处理及分析方法 |
| 3 结果与分析 |
| 3.1 抑病性土壤可培养细菌多样性分析 |
| 3.1.1 可培养细菌分离及鉴定 |
| 3.1.2 杀线虫菌种的筛选 |
| 3.1.3 盆栽试验 |
| 3.1.4 Bacillus sp.AMCC1040 的系统鉴定 |
| 3.2 高地芽孢杆菌AMCC1040 田间防治效果评价 |
| 3.2.1 Real time-PCR定量检测体系 |
| 3.2.2 大田试验 |
| 3.2.2.1 菌剂定殖能力及对虫口密度的影响 |
| 3.2.2.2 菌剂对根内线虫发育的影响 |
| 3.2.2.3 菌剂防治效果评价 |
| 3.2.2.4 大姜根结线虫病发病规律 |
| 3.2.2.5 菌剂对根际微生态影响 |
| 3.3 高地芽孢杆菌杀线虫活性成分分析 |
| 3.3.1 活性物质基本性质 |
| 3.3.1.1 杀线虫动力学性质 |
| 3.3.1.2 活性物质稳定性 |
| 3.3.1.3 活性物质吸附性 |
| 3.3.1.4 活性物质挥发性 |
| 3.3.2 挥发性杀线虫成分分析 |
| 3.4 正辛酸杀线虫作用机理 |
| 3.4.1 正辛酸杀线虫特性 |
| 3.4.2 正辛酸对线虫虫体结构的影响 |
| 3.4.2.1 对线虫虫体形态的影响 |
| 3.4.2.2 对线虫结构成分的影响 |
| 3.4.3 转录组分析 |
| 3.4.3.1 转录组质量分析 |
| 3.4.3.2 差异基因筛选 |
| 3.4.3.3 差异表达基因GO富集分析 |
| 3.4.3.4 差异表达基因KEGG富集分析 |
| 3.4.3.5 正辛酸杀线虫作用机理模型 |
| 3.4.3.6 模型验证 |
| 4 讨论 |
| 4.1 抑病性土壤中杀线虫细菌分析 |
| 4.2 高地芽孢杆菌AMCC1040 生防潜力 |
| 4.3 高地芽孢杆菌AMCC1040 杀线虫挥发性物质 |
| 4.4 正辛酸作用机理 |
| 5 结论 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 攻读学位期间发表的论文及成果 |
（3）邯郸市设施蔬菜根结线虫发生现状、种类鉴定及毒性变异研究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| Abstract |
| 第1章 绪论 |
| 1.1 根结线虫研究概况 |
| 1.1.1 研究背景 |
| 1.1.2 根结线虫发生与为害 |
| 1.2 根结线虫防治 |
| 1.2.1 农业防治 |
| 1.2.2 物理防治 |
| 1.2.3 化学防治 |
| 1.2.4 生物防治 |
| 1.3 根结线虫鉴定方法 |
| 1.3.1 根结线虫传统鉴定方法 |
| 1.3.2 根结线虫分子生物学鉴定方法 |
| 1.4 根结线虫毒性变异研究 |
| 1.4.1 根结线虫毒性种群的主要类群及特征 |
| 1.4.2 根结线虫毒性变异机制 |
| 1.4.3 毒性线虫防治策略 |
| 1.5 本论文研究内容、目的及意义 |
| 1.5.1 研究内容 |
| 1.5.2 研究目的及意义 |
| 1.5.3 技术路线 |
| 第2章 邯郸市设施蔬菜根结线虫发生情况和严重程度调查 |
| 2.1 材料与方法 |
| 2.1.1 邯郸市设施蔬菜根结线虫样本采集 |
| 2.1.2 邯郸市设施蔬菜根结线虫发病率和病情指数的调查 |
| 2.2 结果与分析 |
| 2.2.1 邯郸市设施蔬菜根结线虫的分布情况 |
| 2.2.2 邯郸市设施蔬菜根结线虫发生严重程度情况 |
| 2.2.3 根结线虫为害寄主地上及地下部分症状观察 |
| 2.3 小结 |
| 第3章 邯郸市设施蔬菜根结线虫种类鉴定研究 |
| 3.1 材料与方法 |
| 3.1.1 根结线虫样本采集与二龄幼虫分离 |
| 3.1.2 二龄幼虫永久玻片制作 |
| 3.1.3 雌虫会阴花纹制作与鉴定 |
| 3.1.4 rDNA-ITS技术鉴定 |
| 3.1.5 分子生物学技术验证 |
| 3.2 结果与分析 |
| 3.2.1 根结线虫形态学分析 |
| 3.2.2 PCR鉴定结果与分析 |
| 3.2.3 根结线虫系统发育树分析 |
| 3.2.4 特异性引物对根结线虫鉴定结果的验证 |
| 3.3 小结 |
| 第4章 邯郸市设施蔬菜根结线虫毒性测定 |
| 4.1 材料与方法 |
| 4.1.1 试验材料 |
| 4.1.2 试验方法 |
| 4.2 结果与分析 |
| 4.3 小结 |
| 结论 |
| 参考文献 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文和参加科研情况 |
| 致谢 |
| 作者简介 |
（4）芽孢杆菌AMCC100018杀南方根结线虫活性物质的研究（论文提纲范文）
| 中文摘要 |
| Abstract |
| 1 前言 |
| 1.1 根结线虫简介 |
| 1.1.1 根结线虫的发现与分类 |
| 1.1.2 根结线虫的生活史与侵染机理 |
| 1.1.3 根结线虫的危害 |
| 1.2 根结线虫防治 |
| 1.2.1 农业防治 |
| 1.2.1.1 轮作防治 |
| 1.2.1.2 调节播种时间 |
| 1.2.1.3 种植抗虫品种 |
| 1.2.2 物理防治 |
| 1.2.3 化学防治 |
| 1.2.4 生物防治 |
| 1.2.4.1 食线虫真菌 |
| 1.2.4.2 根际菌群 |
| 1.2.4.3 生物源杀虫剂 |
| 1.2.4.4 诱导宿主抗性 |
| 1.3 芽孢杆菌的研究现状 |
| 1.3.1 杀虫活性 |
| 1.3.2 抗菌活性 |
| 1.3.3 有机污染物降解功能 |
| 1.3.4 芽孢杆菌的其他功能 |
| 1.4 微生物的代谢产物的研究方法 |
| 1.4.1 微生物代谢产物的概况 |
| 1.4.2 微生物代谢产物的提取 |
| 1.4.2.1 液液萃取 |
| 1.4.2.2 大孔吸附树脂 |
| 1.4.2.3 离子交换柱层析 |
| 1.4.2.4 反相硅胶柱层析 |
| 1.4.2.5 凝胶柱层析 |
| 1.4.3 微生物代谢产物的鉴定方法 |
| 1.4.3.1 薄层层析 |
| 1.4.3.2 高效液相色谱 |
| 1.4.3.3 红外吸收光谱技术 |
| 1.4.3.4 紫外吸收光谱 |
| 1.4.3.5 液质联用 |
| 1.5 研究的目的及意义 |
| 2 材料与方法 |
| 2.1 实验材料 |
| 2.1.1 实验菌种及线虫 |
| 2.1.2 培养基及常用储备液 |
| 2.1.3 常用TLC显色剂配置及使用 |
| 2.1.4 试验仪器与设备 |
| 2.1.5 试验试剂 |
| 2.1.6 层析柱及填料 |
| 2.2 试验方法 |
| 2.2.1 南方根结线虫 |
| 2.2.1.1 南方根结线虫的获取 |
| 2.2.1.2 南方根结线虫死亡的判断 |
| 2.2.1.3 南方根结线虫的死亡率 |
| 2.2.2 AMCC100018杀虫活性基本性质试验 |
| 2.2.2.1 发酵时间对杀虫活性的影响 |
| 2.2.2.2 菌落传代数对杀虫活性的影响 |
| 2.2.2.3 温度对杀虫活性的影响 |
| 2.2.2.4 pH对杀虫活性的影响 |
| 2.2.2.5 有机溶剂萃取试验 |
| 2.2.2.6 蛋白酶对杀虫活性的影响 |
| 2.2.2.7 贮藏对杀虫活性的影响 |
| 2.2.3 活性物质分离纯化 |
| 2.2.3.1 大孔吸附树脂的筛选 |
| 2.2.3.2 离子交换树脂的筛选 |
| 2.2.3.3 RP-C18柱层析 |
| 2.2.3.4 Sephadex LH-20分子筛层析 |
| 2.2.3.5 液相色谱纯化 |
| 2.2.3.5.1 紫外光谱扫描 |
| 2.2.3.5.2 制备液相精细分离 |
| 2.2.3.6 薄层层析 |
| 2.2.3.7 分析型液相检测 |
| 2.2.3.8 红外光谱扫描 |
| 2.2.3.9 液质联用 |
| 2.2.4 标品活性验证 |
| 3 试验结果 |
| 3.1 杀虫活性基本性质的研究 |
| 3.1.1 发酵时间对杀虫活性的影响 |
| 3.1.2 菌落传代数对杀虫活性的影响 |
| 3.1.3 温度对杀虫活性的影响 |
| 3.1.4 pH对杀虫活性的影响 |
| 3.1.5 溶媒萃取对杀虫活性的影响 |
| 3.1.6 蛋白酶对杀虫活性的影响 |
| 3.1.7 贮藏对杀虫活性的影响 |
| 3.1.8 杀虫活性基本性质的小结 |
| 3.2 活性物质分离纯化 |
| 3.2.1 大孔吸附树脂的筛选 |
| 3.2.2 阴阳离子交换树脂的筛选 |
| 3.2.2.1 阳离子交换树脂的筛选 |
| 3.2.2.2 阴离子交换树脂的筛选 |
| 3.2.3 大孔吸附树脂预处理 |
| 3.2.4 RP-C18与LH-20柱层析分离 |
| 3.2.4.1 第一次RP-C18硅胶柱层析分离 |
| 3.2.4.2 第一次LH-20分子筛层析分离 |
| 3.2.4.3 第二次RP-C18硅胶柱层析分离 |
| 3.2.4.4 第二次LH-20分子筛层析分离 |
| 3.2.5 制备型液相纯化 |
| 3.2.5.1 紫外光谱扫描 |
| 3.2.5.2 制备型液相精细分离 |
| 3.2.6 杀虫活性物质分析 |
| 3.2.6.1 TLC显色 |
| 3.2.6.2 红外光谱扫描 |
| 3.3 液质联用 |
| 3.4 标品杀虫活性验证 |
| 4 讨论 |
| 5 结论 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
（5）东北地区根结线虫的种类分布及南方根结线虫氯离子通道基因分析（论文提纲范文）
| 中文摘要 |
| 英文摘要 |
| 前言 |
| 第一章 根结线虫分类与阿维菌素抗性机理研究进展 |
| 1.1 根结线虫的研究历史 |
| 1.2 根结线虫的种类与分布 |
| 1.3 根结线虫鉴定方法的研究进展 |
| 1.3.1 传统的形态学鉴定方法 |
| 1.3.2 鉴别寄主鉴定方法 |
| 1.3.3 同工酶表型分析鉴定方法 |
| 1.3.4 分子生物学鉴定 |
| 1.4 根结线虫的防治 |
| 1.5 阿维菌素的靶标 |
| 1.6 阿维菌素抗性机理的研究 |
| 1.6.1 代谢抗性 |
| 1.6.2 靶标抗性 |
| 1.7 问题与展望 |
| 第二章 东北地区根结线虫的种类鉴定与分布研究 |
| 2.1 材料与方法 |
| 2.1.1 根结线虫的样本的采集 |
| 2.1.2 根结线虫的分离 |
| 2.1.3 根结线虫的杀死、固定 |
| 2.1.4 根结线虫的形态学鉴定 |
| 2.1.5 根结线虫的分子生物学鉴定 |
| 2.2 结果与分析 |
| 2.2.1 根结线虫的鉴定结果 |
| 2.2.2 根结线虫的形态学特征 |
| 2.2.3 根结线虫的分子生物学鉴定结果 |
| 2.3 小结 |
| 第三章 南方根结线虫谷氨酸氯离子通道基因分析 |
| 3.1 材料和方法 |
| 3.1.1 线虫材料 |
| 3.1.2 试剂与仪器 |
| 3.1.3 南方根结线虫抗药性的室内测定试验 |
| 3.1.4 南方根结线虫氯离子通道蛋白基因的克隆 |
| 3.1.5 南方根结线虫抗性和敏感种群靶标基因扩增 |
| 3.1.6 序列生物信息学分析 |
| 3.2 结果与分析 |
| 3.2.1 南方根结线虫抗性种群和敏感种群对阿维菌素的敏感性 |
| 3.2.2 南方根结线虫抗性和敏感种群氯离子通道基因序列分析 |
| 3.2.3 谷氨酸氯离子通道蛋白的二级结构预测 |
| 3.2.4 谷氨酸氯离子通道蛋白三级结构预测 |
| 3.3 小结 |
| 第四章 结论与讨论 |
| 4.1 东北地区根结线虫的种类与分布 |
| 4.2 南方根结线虫氯离子通道基因分析 |
| 4.3 存在的问题与展望 |
| 参考文献 |
| 附录 |
| 致谢 |
| 攻读学位论文期间发表文章 |
（6）北方根结线虫对温度和无机化合物适应性研究（论文提纲范文）
| 中文摘要 |
| 英文摘要 |
| 第一章 北方根结线虫环境适应性研究进展 |
| 1.1 北方根结线虫的研究进展 |
| 1.1.1 北方根结线虫简介 |
| 1.1.2 北方根结线虫病的发生和危害 |
| 1.1.3 北方根结线虫病的防治 |
| 1.2 植物寄生线虫对环境适应性的研究进展 |
| 1.2.1 植物寄生线虫对温度的适应性 |
| 1.2.2 植物寄生线虫对无机化合物的适应性 |
| 1.2.3 植物寄生线虫对酸碱度的适应性 |
| 1.3 逆境胁迫响应的生理代谢研究进展 |
| 1.3.1 逆境胁迫响应的生理特征 |
| 1.3.2 逆境胁迫响应的防御系统 |
| 1.3.3 逆境胁迫响应的相关代谢途径 |
| 1.4 三代全长转录组的研究进展 |
| 1.4.1 全长转录组的概述 |
| 1.4.2 全长转录组的应用 |
| 第二章 北方根结线虫的鉴定 |
| 2.1 材料与方法 |
| 2.1.1 供试材料 |
| 2.1.2 试验方法 |
| 2.2 结果与分析 |
| 2.2.1 形态学鉴定 |
| 2.2.2 分子生物学鉴定 |
| 2.3 讨论 |
| 第三章 温度对北方根结线虫的影响 |
| 3.1 材料与方法 |
| 3.1.1 供试材料 |
| 3.1.2 试验方法 |
| 3.2 结果与分析 |
| 3.2.1 冷冻处理及防冻脱水处理 |
| 3.2.2 冷激和冷驯化处理 |
| 3.2.3 高温对北方根结线虫J2 存活的影响 |
| 3.2.4 低温对北方根结线虫卵囊孵化的影响 |
| 3.2.5 高温对北方根结线虫卵囊孵化的影响 |
| 3.3 讨论 |
| 第四章 无机化合物对北方根结线虫的影响 |
| 4.1 材料与方法 |
| 4.1.1 试验材料 |
| 4.1.2 试验方法 |
| 4.2 结果与分析 |
| 4.2.1 无机化合物对北方根结线虫J2 存活的影响 |
| 4.2.2 不同pH对北方根结线虫J2 存活的影响 |
| 4.2.3 敏感化合物对北方根结线虫卵囊孵化的影响 |
| 4.3 讨论 |
| 第五章 北方根结线虫全长转录组分析 |
| 5.1 材料与方法 |
| 5.1.1 供试材料 |
| 5.1.2 试验方法 |
| 5.2 结果与分析 |
| 5.2.1 三代测序数据统计 |
| 5.2.2 三代转录本全长序列统计 |
| 5.2.3 Isoform聚类及校正 |
| 5.2.4 三代转录本结构分析 |
| 5.3 讨论 |
| 第六章 北方根结线虫内参基因筛选 |
| 6.1 材料与方法 |
| 6.1.1 供试材料 |
| 6.1.2 试验方法 |
| 6.2 结果与分析 |
| 6.2.1 候选内参基因的引物扩增效率和特异性 |
| 6.2.2 候选内参基因的Cq值分析 |
| 6.2.3 候选内参基因稳定性评估 |
| 6.2.4 内参基因稳定性的验证 |
| 6.3 讨论 |
| 第七章 北方根结线虫响应相关逆境因子胁迫的生理代谢研究 |
| 7.1 材料与方法 |
| 7.1.1 供试材料 |
| 7.1.2 试验方法 |
| 7.2 结果与分析 |
| 7.2.1 响应相关逆境因子胁迫的水解氨基酸含量变化 |
| 7.2.2 响应相关逆境因子胁迫的生理指标变化 |
| 7.2.3 响应相关逆境因子胁迫的防御酶变化 |
| 7.2.4 响应相关逆境因子胁迫的代谢酶变化及基因表达差异 |
| 7.2.5 响应相关逆境因子胁迫的信号途径分析 |
| 7.3 讨论 |
| 第八章 结论与展望 |
| 8.1 北方根结线虫的鉴定 |
| 8.2 温度对北方根结线虫的影响 |
| 8.3 无机化合物对北方根结线虫的影响 |
| 8.4 北方根结线虫全长转录组分析 |
| 8.5 北方根结线虫内参基因筛选 |
| 8.6 北方根结线虫响应相关逆境因子胁迫的生理代谢研究 |
| 8.7 展望 |
| 8.8 本文主要创新 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 攻读博士期间发表的论文 |
（7）产尿素细菌的物种多样性及其在线虫生防中的应用研究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| Abstract |
| 第一章 文献综述 |
| 1.根结线虫病的危害与化学防治 |
| 2.微生物在根结线虫防治中的作用 |
| 2.1 食线虫细菌在根结线虫防治中的作用 |
| 2.2 食线虫真菌在根结线虫防治中的作用 |
| 3.蚯蚓粪微生物多样性的研究 |
| 4.产尿素细菌是线虫生防重要新资源 |
| 4.1细菌产生的尿素在脲酶催化下释放杀线虫毒力因子NH3 |
| 4.2 产尿素细菌驱动捕食线虫真菌捕食线虫显示出潜在的生防价值 |
| 5.细菌的产尿素机制研究 |
| 6.本论文的研究内容、目的及意义 |
| 第二章 蚯蚓粪的产尿素细菌的物种多样性研究 |
| 1.材料仪器 |
| 1.1 蚯蚓粪样品 |
| 1.2 培养基及其配制 |
| 1.3 试剂及其配制 |
| 1.4 主要仪器 |
| 2.方法 |
| 2.1 蚯蚓粪中细菌的分离 |
| 2.2 产尿素细菌的初筛 |
| 2.3 产尿素细菌发酵液中的尿素含量测定 |
| 2.4 产尿素细菌的系统发育分析 |
| 3.结果 |
| 3.1 蚯蚓粪中产尿素细菌的分离结果 |
| 3.2 细菌发酵液的尿素含量定量测定 |
| 3.3 产尿素细菌的系统发育分析 |
| 4.分析讨论 |
| 第三章 潜在细菌新物种的多相分类 |
| 1.材料与方法 |
| 1.1 实验菌株 |
| 1.2分类鉴定相关分子生物学实验 |
| 1.3形态学及生理学实验 |
| 1.4化学分类相关实验 |
| 2.结果 |
| 2.1 1.1416~T菌株的分类鉴定 |
| 2.2 1.3611~T菌株的分类鉴定 |
| 3.分析讨论 |
| 第四章 产尿素细菌的杀线虫活性及对根结线虫病的防效 |
| 1.材料仪器 |
| 1.1 培养基及其配制 |
| 1.2 供试线虫及培养 |
| 1.3 盆栽实验材料 |
| 1.4 主要仪器 |
| 2.方法 |
| 2.1 杀线虫产尿素细菌的筛选 |
| 2.2 盆栽实验 |
| 3.结果 |
| 3.1 产尿素细菌对线虫的活性 |
| 3.2 产尿素细菌对番茄生长的影响 |
| 3.3 不同处理对根结线虫病的防治效果 |
| 4.分析讨论 |
| 第五章 细菌产尿素机制的初步研究 |
| 1.材料 |
| 1.1 供试菌株及培养基 |
| 1.2 主要仪器 |
| 2.方法 |
| 2.1 产尿素细菌RocF基因的扩增 |
| 2.2 Bacillus zhangzhouensis的全基因组测序 |
| 2.3 Bacillus zhangzhouensis的转录组测序 |
| 3.结果 |
| 3.1 产尿素细菌RocF基因的扩增 |
| 3.2 Bacillus zhangzhouensis的全基因组测序结果 |
| 3.3 Bacillus zhangzhouensis的转录组测序结果 |
| 4.分析讨论 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 硕士研究生期间发表的论文 |
| 附件 |
（8）伴生植物根系分泌物对根结线虫及番茄抗性的影响（论文提纲范文）
| 摘要 |
| 英文摘要 |
| 1 前言 |
| 1.1 研究目的与意义 |
| 1.2 国内外研究进展 |
| 1.2.1 根结线虫病的为害及其防治 |
| 1.2.2 间作(伴生)、套作对根结线虫的影响 |
| 1.2.3 “杀线”植物对根结线虫的影响 |
| 1.2.4 根系分泌物对根结线虫的作用 |
| 1.2.5 植物根系分泌物对植物抗性的影响研究进展 |
| 1.2.6 伴生植物资源的筛选 |
| 1.2.7 转录组技术在抗病研究中的应用 |
| 1.3 研究内容及技术路线 |
| 2 材料与方法 |
| 2.1 试验材料 |
| 2.1.1 供试材料 |
| 2.1.2 化学试剂 |
| 2.1.3 仪器设备 |
| 2.2 试验设计 |
| 2.2.1 减轻番茄根结线虫病的伴生植物筛选 |
| 2.2.2 伴生植物根系分泌物对根结线虫的影响 |
| 2.2.3 伴生植物根系分泌物对番茄抗性的影响 |
| 2.3 试验方法 |
| 2.3.1 测定项目与方法 |
| 2.3.2 番茄根系抗性基因的测定 |
| 2.3.3 转录组测序 |
| 2.4 数据分析 |
| 3 结果与分析 |
| 3.1 减轻番茄根结线虫病的伴生植物的筛选 |
| 3.1.1 不同植物伴生对番茄根结线虫数量的影响(初筛) |
| 3.1.2 不同植物伴生对番茄根结线虫病的影响(复筛) |
| 3.2 伴生植物根系分泌物对番茄根结线虫的影响 |
| 3.2.1 伴生植物根系分泌物对根结线虫虫卵孵化的影响 |
| 3.2.2 伴生植物根系分泌物对根结线虫趋化性的影响 |
| 3.2.3 伴生植物根系分泌物对根结线虫毒杀作用的影响 |
| 3.3 伴生植物根系分泌物对番茄抗性的影响 |
| 3.3.1 伴生植物根系分泌物对番茄根系防御酶活性的影响 |
| 3.3.2 伴生植物根系分泌物对番茄根系总酚和木质素含量的影响 |
| 3.3.3 伴生植物根系分泌物对番茄根系MDA含量的影响 |
| 3.3.4 伴生植物根系分泌物对番茄根系抗性相关基因的影响 |
| 3.4 番茄接种根结线虫后不同时期根系的转录组分析 |
| 3.4.1 样品RNA质量检测 |
| 3.4.2 测序数据质量的剪切与统计 |
| 3.4.3 基因定量和样品相关性分析 |
| 3.4.4 差异基因表达分析 |
| 3.4.5 差异表达基因(DEGs)GO富集分析 |
| 3.4.6 差异表达基因(DEGs)KEGG功能注释分析 |
| 3.4.7 与木质素合成相关的差异表达基因分析 |
| 3.4.8 与抗病相关的差异表达基因分析 |
| 3.4.9 与植物激素和转录因子相关的差异表达基因分析 |
| 3.4.10 差异表达基因的qRT-PCR验证 |
| 4 讨论 |
| 4.1 减轻番茄根结线虫病的伴生植物的筛选 |
| 4.2 伴生植物根系分泌物对根结线虫的直接抑制作用 |
| 4.3 伴生植物根系分泌物对番茄抗性的影响 |
| 4.3.1 伴生植物根系分泌物对番茄根系的抗性生理响应 |
| 4.3.2 伴生植物根系分泌物对番茄根系的抗病相关基因的表达 |
| 4.3.3 添加伴生植物根系分泌物后不同侵染时期番茄根系转录组分析 |
| 5 结论 |
| 致谢 |
| 参考文献 |
| 附录 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 |
（9）根结线虫侵染番茄过程中相关细菌菌群及其功能的宏基因组学分析（论文提纲范文）
| 中文摘要 |
| Abstract |
| 绪论 |
| 1 根结线虫的危害与防治 |
| 1.1 根结线虫 |
| 1.2 根结线虫的危害 |
| 1.3 根结线虫的防治 |
| 2 植物微生物组的群落结构组成与功能 |
| 2.1 植物微生物组 |
| 2.2 植物微生物组的形成 |
| 2.3 微生物组定殖于宿主内的机制 |
| 2.4 植物微生物组群落结构组成机制 |
| 2.5 植物微生物组群落功能 |
| 2.6 番茄根系微生物组 |
| 3 根结线虫相关微生物组的群落结构与功能的研究 |
| 3.1 根结线虫伴生微生物 |
| 3.2 多组学测序技术在植物微生物组与线虫相互作用研究中的应用 |
| 4 本课题研究内容、目的及意义 |
| 第一章 线虫侵染对番茄根系微生物组影响的生物信息学分析 |
| 1 材料和方法 |
| 1.1 实验材料 |
| 1.2 实验方法 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 番茄不同阶段下对根系菌群多样性和群落结构的影响 |
| 2.2 不同处理组微生物群落β-多样性模式和微生物群落的差异分解分析 |
| 2.3 番茄生长不同阶段下根内生细菌的富集性与相关性分析 |
| 2.4 宏基因组评估对番茄根内与根际细菌群落结构组成及功能 |
| 3 本章小结 |
| 第二章 健康与感染根结线虫的番茄生长不同时期的蛋白组学分析 |
| 1 材料和方法 |
| 1.1 试剂与材料 |
| 1.2 实验方法 |
| 1.3 数据处理与分析 |
| 2 结果和分析 |
| 2.1 不同时期番茄内生细菌差异蛋白表达分析 |
| 2.2 不同时期差异蛋白Gene Ontology(GO)二级差异注释分类 |
| 2.3 不同生长阶段番茄内生细菌差异蛋白KEGG通路聚类分析 |
| 3 本章小结 |
| 第三章 不同菌株处理感染根结线虫的番茄根内生细菌的变化 |
| 1 材料和方法 |
| 1.1 植物与微生物材料 |
| 1.2 实验方法 |
| 1.3 扩增子Miseq高通量测序 |
| 1.4 原始序列的处理与统计 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 不同菌株侵染番茄根对防治根结线虫效果 |
| 2.2 不同菌株侵染对番茄根内生细菌群落结构组成及多样性的影响 |
| 2.3 不同菌株侵染后番茄内生细菌的差异性检验以及富集性分析 |
| 3 本章小结 |
| 参考文献 |
| 攻读学位期间承担的科研任务与主要成果 |
| 致谢 |
| 个人简历 |
（10）桑树对象耳豆根结线虫抗性反应的转录组分析（论文提纲范文）
| 摘要 |
| abstract |
| 1 前言 |
| 1.1 桑树及象耳豆根结线虫的概况 |
| 1.2 桑树根结线虫病病原的研究进展 |
| 1.2.1 桑树根结线虫病危害状 |
| 1.2.2 桑树根结线虫病国内外发生情况 |
| 1.3 植物抗根结线虫侵染的相关机制研究 |
| 1.3.1 被动抗性 |
| 1.3.2 主动抗性 |
| 1.4 转录组测序技术在植物与线虫互作研究中的应用概况 |
| 1.5 目的意义、研究内容和技术路线 |
| 1.5.1 目的意义 |
| 1.5.2 研究内容 |
| 1.5.3 技术路线 |
| 2 桑树品种对象耳豆根结线虫的抗性鉴定 |
| 2.1 材料与方法 |
| 2.1.1 试验材料 |
| 2.1.2 试验方法 |
| 2.1.3 测定指标及计算方法 |
| 2.1.4 试验数据统计及分析 |
| 2.2 结果与分析 |
| 2.2.1 不同桑树品种对象耳豆根结线虫的抗性反应 |
| 2.2.2 基于GI、EI、RF和DI指标的抗病性评价 |
| 2.2.3 不同品种桑树抗象耳豆根结线虫能力综合评价 |
| 2.3 结论与讨论 |
| 3 象耳豆根结线虫侵染不同抗性桑树品种的转录组分析 |
| 3.1 材料与方法 |
| 3.1.1 试验材料 |
| 3.1.2 试验方法 |
| 3.2 结果与分析 |
| 3.2.1 样品RNA质量检测结果 |
| 3.2.2 转录组测序结果 |
| 3.2.3 Denovo组装结果 |
| 3.2.4 Unigene功能注释结果 |
| 3.2.5 DEGs的筛选 |
| 3.2.6 DEGs的GO富集分析 |
| 3.2.7 DEGs的Pathway富集分析 |
| 3.2.8 DEGs的表达趋势 |
| 3.2.9 关键趋势分析 |
| 3.2.10 关键趋势的共表达网络分析 |
| 3.2.11 DEGs的RT-q PCR结果 |
| 3.3 结论与讨论 |
| 3.3.1 结论 |
| 3.3.2 讨论 |
| 4 全文总结 |
| 4.1 主要结论 |
| 4.2 创新点 |
| 4.3 展望 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 |
四、根结线虫分类手段的研究概况（论文参考文献）
- [1]昆玉市设施番茄和无花果根结线虫的鉴定及防治研究[D]. 党金欢. 塔里木大学, 2021(08)
- [2]根结线虫生防菌高地芽孢杆菌AMCC1040的筛选及杀线虫作用机理研究[D]. 王建宇. 山东农业大学, 2021
- [3]邯郸市设施蔬菜根结线虫发生现状、种类鉴定及毒性变异研究[D]. 李天予. 河北工程大学, 2020(04)
- [4]芽孢杆菌AMCC100018杀南方根结线虫活性物质的研究[D]. 李根. 山东农业大学, 2020
- [5]东北地区根结线虫的种类分布及南方根结线虫氯离子通道基因分析[D]. 宫远福. 沈阳农业大学, 2020(08)
- [6]北方根结线虫对温度和无机化合物适应性研究[D]. 吴晓晶. 沈阳农业大学, 2020(08)
- [7]产尿素细菌的物种多样性及其在线虫生防中的应用研究[D]. 茶琦雁. 云南大学, 2020
- [8]伴生植物根系分泌物对根结线虫及番茄抗性的影响[D]. 杨帆. 东北农业大学, 2020(04)
- [9]根结线虫侵染番茄过程中相关细菌菌群及其功能的宏基因组学分析[D]. 黎烨. 福建师范大学, 2020(12)
- [10]桑树对象耳豆根结线虫抗性反应的转录组分析[D]. 傅昱. 仲恺农业工程学院, 2020(07)